纤毛(Cilia)是大多数真核细胞表面伸出的毛发状结构,是基于微管的细胞器,在细胞感知、信号传导和运动中发挥关键作用。运动纤毛通过快速摆动推动周围液体流动或使细胞在液体中移动。运动纤毛的核心结构是轴丝,呈 “9+2” 排列(9 组外周双微管围绕2根中央单微管),沿轴丝有96纳米重复单元,包含驱动运动的动力蛋白臂及多种调控复合物(如径向辐条等)(图1a-c)。尽管冷冻电镜等技术已解析多数纤毛复合物的结构,但第三径向辐条(RS3)的全长结构(尤其是远端结构和蛋白组成)仍不明确,且动力蛋白马达的时空调控机制尚未完全阐明。
已知RS3有CFAP61、CFAP251、LRRC23、CFAP91四组分。研究人员发现CFAP61 敲除后RS3稳定性下降,经比较蛋白质组学分析,鉴定出87个相关蛋白(49个小鼠中保守),明确AK7、AK9为RS3特异性腺苷酸激酶(adenylate kinases, AK)。利用冷冻电子断层扫描(cryo-ET)进行三维结构成像,结果显示,WT和AK1-KO纤毛未见RS 缺失(图1d-e);但AK7-KO纤毛RS3头部和颈部缺失,仅存部分基部且有不同程度截短(图 1f,g),证明AK7是RS3保守组分。对比WT与AK7-KO小鼠轴丝的 LC-MS 数据,发现有12个蛋白显著减少(含AK9、LRRC23等),进一步锁定RS3核心组分。
之后,研究团队利用冷冻电镜对小鼠气管纤毛轴突进行了单颗粒重构。通过优化方法处理小鼠气管轴丝并采集图像,经优化处理后,获得RS3基-柄部(4.7Å)和颈-头部(7.1Å)的清晰结构。RS全长与RS1、RS2相近,由基部(含两个DMT附着位点)、纤细的柄部(可能提供灵活性)、带四个 “支柱” 的颈部及与中央对复合体作用的扁平头部组成。基部与DMT的连接涉及CFAP251和CFAP57 等关键蛋白(图1h-p)。

图1. 小鼠呼吸道纤毛的结构组织及全长RS3的冷冻电镜单颗粒重建结果
RS3的头部结构
利用已有的人类RS3基部原子模型,结合小鼠蛋白序列和多种结构预测与蛋白组学数据,研究人员成功构建了小鼠RS3的完整原子模型,定位了14种RS3特异性蛋白(其中10种为新发现),并确认了多个与RS3相互作用的蛋白。
其中,RS3头部由5种酸性蛋白组成(包括AK7、AK9和LRRC23),其表面带有高度负电势,这有助于防止RS3头部与中央管复合体碰撞或粘连,从而保证轴突的正常滑动和弯曲功能。头部有6个腺苷酸激酶催化结构域(图2a-h),其中2个AK7各含1个图2a、f、g),AK9含 4个(图2a-e)。AK能催化2分子ADP可逆生成ATP和AMP(图2i),但AK9的2个催化结构域因LRRC23的N端β-发夹插入而受抑制,且二者存在额外相互作用(图2b、c,箭头)。生化实验显示,CFAP61敲除的四膜虫轴丝AK活性显著低于野生型((图2j)),与AK7和AK9 减少一致,表明RS3头部对 ATP再生的重要性。

图2. RS3的AK活性
RS3的头部结构
RS3颈部结构由AK7、AK9的C端区域与MDH1–MDH1B异二聚体形成四个角状支柱,汇聚于远端柄部并与CFAP91的钩状C端作用,结构类似 “固定伞”,具稳定性(图3a-d);相关蛋白含延伸螺旋(如AK7的C端α螺旋、CFAP91的C端片段),CFAP91作为骨架贯穿基部、柄部和颈部(图3a)。冷冻电镜图谱的两个特征支持MDH1–MDH1B 异二聚体的存在(图3a,b),并且对RS3结构完整重要,其中MDH1B的N端球状结构域起间隔作用(图3a),而MDH1参与维持细胞redox平衡。
RS3的柄部结构
RS3柄部中,CFAP91呈高度延伸的α螺旋结构,连接RS2和RS3的DMT对接位点,贯穿基部和柄部,通过与多蛋白相互作用形成约30nm的骨架,类似RS1和RS2中的RSP3(图3a);柄部远端由C10ORF53形成,与MDH1B等相互作用(图3d),近端含AKAP14、MORN5、STYXL1等(图3d, e),MORN5、STYXL1与CFAP91片段形成的复合物可稳定结构;柄部存在 “裸露” 的CFAP91片段,可能作为枢轴点赋予 RS3 灵活性以适应纤毛摆动时的空间变化(图3a);蛋白质组学显示AK7⁻/⁻纤毛中MDH1B等大幅减少,CATIP和PRKAR2A 的功能域不清晰,仅小片段附着于柄部,球状结构域通过长无序连接区相连。

图3. 新鉴定的RS3蛋白间的相互作用
总结
纤毛需精确协调数百个动力蛋白马达以产生特征性的振荡摆动,时空调控不当会导致纤毛麻痹或波形不协调。本篇文章鉴定并定位了所有RS3蛋白组分,揭示了RS3作为代谢中心调控纤毛运动。在已知的4个RS3亚基基础上又新增了10个蛋白质,由此得到了独特的全长RS3结构的原子模型。RS3 含磷酸化调控相关蛋白及能量代谢相关酶,兼具调控与代谢功能,通过维持纤毛中ATP/ADP的适当比例,维持动力蛋白介导的纤毛摆动。