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结构速递 | 一周“结构”要览 VOL.186(10.06~10.12)

2025/10/13


2025.10.06~2025.10.12

CNS刊登文章


01

Nature


本周无




02

 Science 

2025/10/09

1.“Covalent inhibitors of the PI3Kα RAS binding domain impair tumor growth driven by RAS and HER2”

靶向PI3Kα RAS结合结构域的共价抑制剂可抑制RAS和HER2驱动的肿瘤生长


在小鼠中,遗传性破坏磷脂酰肌醇-3-激酶α(PI3Kα)中RAS结合结构域(RBD)的功能,会削弱由小GTP酶RAS驱动的肿瘤生长,但并不影响PI3Kα在胰岛素介导的葡萄糖稳态调控中的作用。选择性阻断RAS与PI3Kα的相互作用,可能成为治疗RAS依赖型癌症的一种策略,因为这种方法可避免传统PI3Kα脂质激酶抑制剂所带来的毒副作用。


来自英国弗朗西斯·克里克研究所的Julian Downward和美国维维迪恩治疗公司的Matthew P. Patricelli团队开发了一类化合物,这些化合物可与PI3K p110α的RBD中第242位半胱氨酸(Cys242)形成共价结合,从而阻断RAS对PI3Kα活性的激活。在小鼠模型中,这些抑制剂能够减缓RAS突变型肿瘤和人表皮生长因子受体2(HER2)过表达肿瘤的生长,尤其在与RAS/丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)通路的其他抑制剂联合使用时效果更佳,而且不会引起高血糖。

2025/10/09

2.“Locating the missing chlorophylls f in far-red photosystem I” 

定位远红光光系统 I 中缺失的叶绿素 f




含有叶绿素 f(chlorophyll f)的光系统的发现,凭借其长波长光化学特性,代表了一种独特的、低能量的产氧光合作用新范式。此前关于含叶绿素 f 的光系统 I(PSI)的结构研究,虽然可以确定部分叶绿素 f 的位置,但未能在光化学活性色素中找到,并得出结论认为叶绿素 f 不参与光化学作用。


在本研究中,来自英国伦敦帝国理工学院的Andrea Fantuzzi和A. William Rutherford团队合作报道了来自 Chroococcidiopsis thermalis PCC 7203 的远红光 PSI(far-red PSI)的两种冷冻电镜(cryo-EM)结构,这使得八个叶绿素 f 分子的位置得以明确,包括参与氧化还原的 A-1B 位点。通过模拟电荷分离引起的吸收差谱(absorption difference spectra),结果表明,只有在 A-1B 位点存在叶绿素 f 的情况下,才能再现实验观测到的光谱。叶绿素 f 的具体位置、波长分配以及保守的远红光特异性残基,为理解如何高效利用长波长光子提供了功能性见解。

03

 Cell 

2025/10/10

“Choreography of rapid actin filament disassembly by coronin, cofilin, and AIP1” 

Coronin、Cofilin 与 AIP1 协同驱动的快速肌动蛋白丝解聚的分子机制


真核细胞的运动与形态发生依赖于肌动蛋白(F-actin)网络的快速重塑。保守的肌动蛋白结合蛋白——冠蛋白(coronin)、离旋蛋白(cofilin)以及肌动蛋白相互作用蛋白 1(AIP1)——协同作用以促进 F-actin 网络的快速解聚,但其具体机制一直不清楚。


来自德国多特蒙德马普分子生理学研究所的Stefan Raunser和英国伦敦国王学院的Peter Bieling团队合作利用冷冻电镜(cryo-EM)揭示了冠蛋白、离旋蛋白和 AIP1 的协同分子作用机制,从而导致肌动蛋白丝的老化与断裂。研究发现,冠蛋白的协作结合变构性地促进 F-actin 中无机磷酸盐的释放,并诱导肌动蛋白丝的反扭曲(undertwisting),从而为离旋蛋白结合做好准备。随后,离旋蛋白通过链状受限的协作结合机制将冠蛋白从肌动蛋白丝上置换下来。形成的 cofilactin 结构为 AIP1 提供了一个高亲和力结合平台,AIP1 通过充当“夹钳”破坏亚基间的丝接触,从而引发肌动蛋白丝的断裂。在这一被称为 “分子挤压(molecular squeezing)” 的机制中,肌动蛋白丝的断裂实际上由 AIP1 而非离旋蛋白执行。本研究重新定义了这些关键解聚因子在肌动蛋白动力学中的作用。




2025.10.06~2025.10.12

子刊刊登文章




01

Cell Research

本周无




02

Molecular Cell

10.09

 “Mechanism of DNA entrapment by a loop-extruding Wadjet SMC motor”

环挤出 Wadjet SMC 马达捕获 DNA 的机制




03

 Nature Structural & Molecular Biology

10.09

“Nuclear pore passage of the HIV capsid is driven by its unusual surface amino acid composition”

HIV 衣壳通过其非凡的表面氨基酸组成穿过核孔的机制 




04

Nature Communications

10.06

1.“Investigating whether deep learning models for co-folding learn the physics of protein-ligand interactions”

研究共折叠深度学习模型是否学习蛋白-配体相互作用的物理原理

10.08

2.“Structural insights into the mechanism of activation and inhibition of the prostaglandin D2 receptor 1”

前列腺素 D2 受体 1 激活与抑制机制的结构学解析

10.08

3.“Combined crystallographic fragment screening and deep mutational scanning enable discovery of Zika virus NS2B-NS3 protease inhibitors”

结合晶体学片段筛选与深度突变扫描实现寨卡病毒 NS2B-NS3 蛋白酶抑制剂的发现

10.08

4.“Cryo-EM structure of the yeast Saccharomyces cerevisiae SDH provides a template for eco-friendly fungicide discovery”

酵母 Saccharomyces cerevisiae SDH 的冷冻电镜结构为环保型杀菌剂开发提供模板

10.08

5.“Demethylation of methylguanidine by a stepwise dioxygenase and lyase reaction”

通过逐步二氧化酶与裂解酶反应实现甲基胍的去甲基化

10.10

6.“LARGE1 processively polymerizes length-controlled matriglycan on prodystroglycan”

LARGE1 在前肌营养糖蛋白上连续聚合长度可控的基底糖链(matriglycan)

10.10

7.“Molecular bases of the interactions of ATG16L1 with FIP200 and ATG8 family proteins”

ATG16L1 与 FIP200 及 ATG8 家族蛋白相互作用的分子基础




05

Science Advances

10.08

1.“Structure and assembly of the A-C linker connecting microtubule triplets in centrioles”

连接中心粒微管三联体的 A-C 链的结构与组装

10.10

2.“Molecular mechanism underlying phosphate distribution by SULTR family transporter SPDT in Oryza sativa”

水稻 SULTR 家族转运蛋白 SPDT 调控磷酸盐分布的分子机制

10.10

3.“Mechanism of USP21 autoinhibition and histone H2AK119 deubiquitination”

USP21 自抑制及组蛋白 H2AK119 去泛素化的机制

10.10

4.“Structural insights into the progressive recovery of α7 nicotinic acetylcholine receptor from nicotine-induced desensitization”

α7 型烟碱乙酰胆碱受体从尼古丁诱导的脱敏状态逐步恢复的结构机制