01
Nature
2024/11/20
“Broadly inhibitory antibodies to severe malaria virulence proteins”
针对严重疟疾毒力蛋白的广泛抑制抗体
疟疾病理学是由恶性疟原虫感染的红细胞在微血管中积聚引起的。该过程由寄生虫的多态性红细胞膜蛋白 1 (PfEMP1) 粘附蛋白介导。通过其 CIDRα1 结构域与人内皮蛋白 C 受体 (EPCR) 结合的 PfEMP1 突变体是导致严重疟疾发病的原因。一个长期存在的问题是单个抗体是否能够识别大量循环 PfEMP1 突变体。
来自丹麦哥本哈根大学的Thomas Lavstsen和Louise Turner以及美国德克萨斯州圣安东尼奥市德克萨斯大学的Evelien M. Bunnik描述了两种对 CIDRα1 具有广泛反应性和抑制性的人类单克隆抗体。从两个不同个体中分离出的抗体表现出相似且一致的 EPCR 结合抑制，抑制不同的 CIDRα1 结构域，代表 CIDRα1 的六个子类中的五个。两种抗体均抑制重组全长和天然 PfEMP1 蛋白的 EPCR 结合，以及在生理相关流动条件下抑制生物工程 3D 人脑微血管中的寄生虫隔离。对两种抗体与三种不同的 CIDRα1 抗原变体复合的结构分析揭示了相似的结合机制，这些机制依赖于与 CIDRα1 中 EPCR 结合位点的三个高度保守的氨基酸残基的相互作用。这些广泛反应的抗体可能代表了对严重疟疾的获得性免疫的共同机制，并为设计针对严重疟疾的疫苗或治疗提供了新的见解。
02
Science
2024/11/21
“Rapid in silico directed evolution by a protein language model with EVOLVEpro”
使用 EVOLVEpro 通过蛋白质语言模型进行快速计算机定向进化
定向蛋白质进化是生物医学应用的核心，但面临着实验复杂性、低效多属性优化和局部最大值陷阱等挑战。虽然使用蛋白质语言模型（PLMs）的硅学方法可以提供建模的适应性景观指导，但它们很难在不同的蛋白质家族中推广并映射到蛋白质活性。
来自美国哈佛大学的Omar O. Abudayyeh和Jonathan S. Gootenberg合作介绍了 EVOLVEpro，这是一种结合了蛋白质语言模型和回归模型的少量主动学习框架，可快速提高蛋白质活性。EVOLVEpro 超越了当前的方法，在所需属性方面的改进高达 100 倍。研究者展示了它在 RNA 生产、基因组编辑和抗体结合应用中对六种蛋白质的有效性。这些结果凸显了利用最少的实验数据进行少次主动学习比零次预测更有优势。EVOLVEpro 为生物学和医学领域的人工智能指导蛋白质工程开辟了新的可能性。
03
Cell
本周无
01
Cell Research
本周无
02
Molecular Cell
本周无
03
Nature Structural & Molecular Biology
11.21
“Na+-V-ATPase inhibitor curbs VRE growth and unveils Na+ pathway structure”
Na+-V-ATPase抑制剂抑制VRE生长并揭示Na+通道结构
04
Nature Communications
11.18
1. “A bitter anti-inflammatory drug binds at two distinct sites of a human bitter taste GPCR”
一种苦味抗炎药结合在人类苦味味觉GPCR的两个不同位点
11.18
2.“The role of ATP-binding Cassette subfamily B member 6 in the inner ear”
ATP结合卡车蛋白B家族成员6在内耳中的作用
11.20
3. “The inhibitory action of the chaperone BRICHOS against the α-Synuclein secondary nucleation pathway”
分子伴侣BRICHOS抑制α-突触核蛋白二级成核途径的作用
11.20
4.“Rotary mechanism of the prokaryotic Vo motor driven by proton motive force”
由质子动力势驱动的原核Vo马达的旋转机制
11.20
5.“Transcription regulation of African swine fever virus: dual role of M1249L”
非洲猪瘟病毒的转录调控：M1249L的双重作用
11.21
6. “Cryo-EM structures of apo-APC/C and APC/CCDH1:EMI1 complexes provide insights into APC/C regulation”
Apo-APC/C和APC/CCDH1:EMI1复合物的Cryo-EM结构揭示APC/C的调控机制
11.21
7.“Dimerization of ADAR1 modulates site-specificity of RNA editing”
ADAR1的二聚化调节RNA编辑的位点特异性
11.22
8.“An inhibitory segment within G-patch activators tunes Prp43-ATPase activity during ribosome assembly”
G-patch激活因子中的抑制段调节Prp43-ATP酶活性在核糖体组装中的作用
11.23
9.“Crystal structures of DCAF1-PROTAC-WDR5 ternary complexes provide insight into DCAF1 substrate specificity”
DCAF1-PROTAC-WDR5三元复合物的晶体结构揭示DCAF1底物特异性
11.24
10. “Structural insight into the distinct regulatory mechanism of the HEPN–MNT toxin-antitoxin system in Legionella pneumophila”
Legionella肺炎分枝杆菌中HEPN-MNT毒素-抗毒素系统的不同调节机制的结构解析
05
Science Advances
11.22
1.“Structural basis for the reaction cycle and transport mechanism of human Na+-sulfate cotransporter NaS1 (SLC13A1)”
人类Na+-硫酸盐共转运蛋白NaS1(SLC13A1)反应循环和运输机制的结构基础
11.22
2.“Structural characterization and AlphaFold modeling of human T cell receptor recognition of NRAS cancer neoantigens”
人类T细胞受体识别NRAS癌症新抗原的结构表征和AlphaFold建模
11.20
3. “Structure of the human TSC:WIPI3 lysosomal recruitment complex”
人类TSC:WIPI3溶酶体招募复合物的结构
