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刘俊杰 博士

2024 国家杰出青年科学基金、谈家桢生命科学创新奖、科学探索奖
2023 北京市优秀青年人才、贝时璋青年生物物理学家
2021 国家优秀青年科学基金(海外)
2020 加州大学伯克利分校突出博士后奖
2018 美国生命科学研究基金奖(Fellowship)

个人履历

2007-2011 四川大学,生命科学学院,学士

2011-2016 清华大学,生命科学学院,博士

2016-2018 劳伦斯-伯克利国家实验室,生物物理和生物成像中心,博士后

2018-2020 加州大学伯克利分校,分子与细胞生物学系,博士后

2018-2020 美国生命科学研究基金(LSRF)研究员(fellow)

2020年9月-2023年11月,清华大学,生命科学学院,助理教授、博士生导师

2020年9月至今,清华大学-北京大学,生命科学联合中心,研究员

2020年9月至今,北京生物结构前沿研究中心,研究员

2023年7月至今,膜生物学国家重点实验室,研究员

2023年12月至今,清华大学,生命科学学院,副教授、博士生导师

2024年7月至今,清华大学,合成与系统生物学中心,研究员

主要科研领域与方向

刘俊杰实验室综合运用生物信息学,生物化学,生物物理学以及细胞生物学等手段从事以下方向的研究:

(1) 新型基因编辑工具的设计与开发

(2) RNA相关核酸酶机器的机制研究

近年来,刘俊杰团队开发了小型CRISPR-CasX、CasPi等基因编辑工具(Mol. Cell, 2022; Cell Res., 2023),有效拓展CRISPR基因编辑工具箱;发现CRISPR免疫增效子(Nature, 2024),有望从多个方面提升Cas9基因编辑性能;创制可水解切割DNA的HYER核酶(Science, 2024),实现不依赖蛋白核酸酶的DNA和RNA可编程操纵;解析R2逆转座子中受结构性RNA调控的基因转座分子机理 (Cell, 2023),指导大片段基因插入工具开发。

代表性论文

1.      Wenjing Xing#, Danyuan Li#, Wenjuan Wang, Jun-Jie Gogo Liu*, Chunlai Chen*. Conformational dynamics of CasX (Cas12e) in mediating DNA cleavage revealed by single-molecule FRET (2024). Nucleic Acids Research , gkae604

2.     Shouyue Zhang#, Ao Sun#, Jing-Mei Qian#, Shuo Lin#, Wenjing Xing, Yun Yang, Han-Zhou Zhu, Xin-Yi Zhou, Yan-Shuo Guo, Yun Liu, Yu Meng, Shu-Lin Jin, Wenhao Song, Cheng-Ping Li, Zhaofu Li, Shuai Jin, Jian-Hua Wang, Meng-Qiu Dong, Caixia Gao, Chunlai Chen*, Yang Bai* & Jun-Jie Gogo Liu*. Pro-CRISPR PcrIIC1 associated Cas9 system for enhanced bacterial immunity (2024). Nature, 630, 484–492.

3.     Zi-Xian Liu#, Shouyue Zhang#, Han-Zhou Zhu#, Zhi-Hang Chen#, Yun Yang#, Long-Qi Li#, Yuan Lei, Yun Liu, Dan-Yuan Li, Ao Sun, Cheng-Ping Li, Shun-Qing Tan, Gao-Li Wang, Jie-Yi Shen, Shuai Jin, Caixia Gao, Jun-Jie Gogo Liu*. Hydrolytic endonucleolytic ribozyme (HYER) is programmable for sequence-specific DNA cleavage (2024). Science, 383(6682): eadh4859.

4.     Pujuan Deng#, Shun-Qing Tan#, Qi-Yu Yang, Liangzheng Fu, Yachao Wu, Han-Zhou Zhu, Lei Sun, Zhangbin Bao, Yi Lin, Qiangfeng Cliff Zhang, Haoyi Wang, Jia Wang*, Jun-Jie Gogo Liu*. Structural RNA components supervise the sequential DNA cleavage in R2 retrotransposon (2023). Cell, 186(13):2865-2879.

5.     Dan-Yuan Li#, Long-Qi Li#, Jun-Jie Gogo Liu*. Nucleases in gene-editing technologies: past and prologue (2023). National Science Open,2(5): 20220067.

6.     Zhian Hu#, Ao Sun#, Jinlei Yang, Gul Naz, Gongwei Sun, Zhengping Li, Jun-Jie Gogo Liu*, Sichun Zhang*, Xinrong Zhang*. Regulation of the CRISPR-Cas12a system by methylation and demethylation of guide RNA (2023). Chemical Science, 14(22):5945-5955.

7.     Ao Sun#, Cheng-Ping Li#, Zhihang Chen#, Shouyue Zhang#, Dan-Yuan Li, Yun Yang, Long-Qi Li, Yuqian Zhao, Kaichen Wang, Zhaofu Li, Jinxia Liu, Sitong Liu, Jia Wang*, Jun-Jie Gogo Liu*. The compact Casπ (Cas12l) ‘bracelet’ provides a unique structural platform for DNA manipulation (2023). Cell Research, 33(3), 229–244.

8.     Connor A Tsuchida#, Shouyue Zhang#, Mohammad Saffari Doost#, Yuqian Zhao#, Jia Wang, Elizabeth O'Brien, Huan Fang, Cheng-Ping Li, Danyuan Li, Zhuo-Yan Hai, Jonathan Chuck, Julian Brötzmann, Araz Vartoumian, David Burstein, Xiao-Wei Chen, Eva Nogales, Jennifer A Doudna*, Jun-Jie Gogo Liu*. Chimeric CRISPR-CasX enzymes and guide RNAs for improved genome editing activity (2022). Molecular Cell, 82(6):1199-1209.e6.

9.     Mengyi Yang, Ruirui Sun, Pujuan Deng, Yuzhuo Yang, Wenjuan Wang, Jun-Jie Gogo Liu*, Chunlai Chen *. Nonspecific interactions between SpCas9 and dsDNA sites located downstream of the PAM mediate facilitated diffusion to accelerate target search (2021). Chemical Science, 12(38):12776-12784.

10. Jun-Jie Liu#, Natalia Orlova#, Benjamin L Oakes#, Enbo Ma, Hannah B Spinner, Katherine L M Baney, Jonathan Chuck, Dan Tan, Gavin J Knott, Lucas B Harrington, Basem Al-Shayeb, Alexander Wagner, Julian Brötzmann, Brett T Staahl, Kian L Taylor, John Desmarais, Eva Nogales*, Jennifer A Doudna*. CasX enzymes comprise a distinct family of RNA-guided genome editors (2019). Nature, 566(7743),218-223.